Έξι νέες συνδέσεις εσωτερικού προστέθηκαν στο θερινό πρόγραμμα της Aegean Airlines για το 2025.
Ειδικότερα, προστέθηκαν τρεις συνδέσεις από το Ηράκλειο προς Κέρκυρα, Κω και Νάξο. Η σύνδεση με Κέρκυρα θα πραγματοποιείται από τις 2 Ιουνίου έως τις 12 Σεπτεμβρίου, 2 φορές την εβδομάδα, με αεροσκάφος A320. Το δρομολόγιο αυτό επανέρχεται μετά τον Ιούλιο/ Αύγουστο του 2021 όταν πραγματοποιήθηκε για τελευταία φορά από την Olympic Air.
Η σύνδεση Ηράκλειο – Κως έχει προγραμματιστεί από τις 2 Ιουνίου έως τις 10 Οκτωβρίου 2025, με συχνότητα 3 φορές την εβδομάδα και αεροσκάφος ATR42 και το Ηράκλειο – Νάξος θα ξεκινήσει την 1η Ιουνίου και θα ολοκληρωθεί στις 12 Οκτωβρίου, με συχνότητα πτήσεων 2 φορές την εβδομάδα και ίδιου τύπου αεροσκάφος.
Παράλληλα, εισάγονται τρία νέα δρομολόγια από Ρόδο, με Χανιά, Ηράκλειο και Σαντορίνη που θα πραγματοποιούνται με αεροσκάφος ATR42. Η σύνδεση με Χανιά θα ξεκινήσει στις 14 Απριλίου με 2 εβδομαδιαίες πτήσεις οι οποίες θα γίνουν 4 εβδομαδιαίες από 1η Ιουνίου έως 12 Οκτωβρίου, το δρομολόγιο προς Ηράκλειο ξεκινάει στις 30 Μαρτίου με μία καθημερινή πτήση και επαναφέρεται από τον Ιούνιο του 2022 όταν πραγματοποιήθηκε για τελευταία φορά από την Olympic Air, και, τέλος, η σύνδεση Ρόδος – Σαντορίνη θα πραγματοποιείται από τις 3 Ιουνίου έως τις 11 Οκτωβρίου 2025, 3 φορές την εβδομάδα.
Πρόσφατα προστέθηκε στο θερινό πρόγραμμα του 2025 και η σύνδεση Θεσσαλονίκη – Σύρος, η οποία θα πραγματοποιείται από τις 3 Ιουνίου έως τις 30 Σεπτεμβρίου με συχνότητα 3 φορές την εβδομάδα και αεροσκάφος ATR72.